Alessandro Vinceti
- Postdoc, Iorio Group
Alessandro Vinceti è dottorando presso il Centro di Biologia Computazionale dello Human Technopole. Ha conseguito una laurea in Biotecnologie presso l’Università di Modena e Reggio Emilia, seguita da un Master in Bioinformatica presso l’Università di Bologna.
Nell’ambito del suo dottorato di ricerca, Alessandro sta contribuendo allo sviluppo di strumenti per la correzione e l’analisi dei dati derivati da CRISPR-Cas9 screen basati su ampie coorti di linee cellulari tumorali umane immortalizzate. L’obiettivo è sfruttare le caratteristiche genetiche dei modelli tumorali per trovare bersagli terapeutici adatti che portino allo sviluppo/riproduzione del farmaco giusto per il paziente giusto, secondo i principi della medicina di precisione.
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Pubblicazioni
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11/2021 - BMC Genomics
CoRe: a robustly benchmarked R package for identifying core-fitness genes in genome-wide pooled CRISPR-Cas9 screens
Background CRISPR-Cas9 genome-wide screens are being increasingly performed, allowing systematic explorations of cancer dependencies at unprecedented accuracy and scale. One of the major computational challenges when analysing data derived from such screens is to identify genes that are essential for cell survival invariantly across tissues, conditions, and genomic-contexts (core-fitness genes), and to distinguish them from […]
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01/2021 - Genome Biology
Minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library
CRISPR guide RNA libraries have been iteratively improved to provide increasingly efficient reagents, although their large size is a barrier for many applications. We design an optimised minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library (MinLibCas9) by mining existing large-scale gene loss-of-function datasets, resulting in a greater than 42% reduction in size compared to other CRISPR-Cas9 libraries while […]
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