Piattaforma Nazionale di Genomica

Il sistema 4200 TapeStation è una piattaforma automatizzata di elettroforesi per il controllo della qualità dei campioni di DNA e RNA. Il processamento completamente automatizzato dei campioni consente l’analisi della dimensione, concentrazione ed integrità degli stessi. Questo sistema rappresenta una soluzione completa per il controllo della qualità dei campioni in qualsiasi workflow NGS o di Biobanking.

Il sistema Fragment Analyzer utilizza l’elettroforesi capillare parallela automatizzata per fornire un controllo di qualità (QC) affidabile e ad alta sensibilità per gli acidi nucleici. I comuni colli di bottiglia del QC vengono risolti grazie all’automazione di fasi chiave come il caricamento del gel e l’iniezione del campione, aumentando l’efficienza del laboratorio.

Il sistema Femto Pulse è un sistema automatico di elettroforesi capillare a campo pulsato che raggiunge una sensibilità 10 volte superiore per gli smear di acidi nucleici e fino a 100 volte per i frammenti rispetto a quello standard. Il campo pulsato consente di rilevare acidi nucleici nel range dei femtogrammi.

GloMax® Discover è un lettore di piastre multimodale che consente un uso flessibile dei filtri e include funzionalità ad alta prestazione di luminescenza, fluorescenza, assorbanza UV-Visibile, BRET e FRET, luminescenza filtrata a due colori. Può essere integrato in workflows high-throughput automatizzati.

Si tratta di uno strumento per la purificazione automatizzata di acidi nucleici a medio e alto throughput nel formato a 96 pozzetti.

Caratteristiche:

• Estrazione affidabile di DNA, RNA e miRNA virtualmente da qualsiasi tipo di campione.
• Quale sistema a medio e alto throughput che usa kit di purificazione dedicati, consente di risparmiare costi e tempo
• Il software è user-friendly e consente una facile gestione dei dati e documentazione
• Attraverso un design innovativo la sicurezza è aumentata e la contaminazione incrociata dei campioni ridotta al minimo
• Strumento conveniente, flessibile e facile da usare, con un ingombro ridotto

La workstation Agilent Bravo NGS si basa sul sistema robotizzato di liquid handling Bravo che è preconfigurato per protocolli di NGS per la preparazione e l’arricchimento delle librerie. Un’interfaccia semplice e intuitiva consente agli utenti di impostare ed eseguire rapidamente i protocolli pre-programmati.

Il Covaris E220 consente la preparazione di batch multi-campione ed è in grado di processare un’ampia gamma di tipi di campioni e volumi. L’E220 può essere programmato per processare da 1 a 96 campioni in un singolo batch. Ad esempio, con 96 campioni, è possibile pre-programmare 96 diverse energie AFA (Adaptive Focused Acoustics).

Il Liquid Handler Echo 525R consente di trasferire quantità piccole, accurate e precise di campioni e reagenti per ottenere volumi di reazione miniaturizzati. La miniaturizzazione della preparazione delle librerie NGS riduce il costo dei reagenti e la quantità di input di campione necessaria, aumentando al contempo la produttività e fornendo dati di sequenziamento di alta qualità.

La Workstation automatizzata Biomek i7 è stata progettata per ottimizzare l’affidabilità e i tempi di funzionamento autonomo nei laboratori a produttività medio-alta. Il Biomek i7 può essere dotato fino ad un massimo di 45 posizioni sul deck, può includere sia testate di pipette multicanale sia Span-8 ed è in grado di trasferire volumi da 0,5 µL a 5.000 µL. Può essere integrato con il Liquid Handler Echo per la miniaturizzazione dei volumi.

Il sistema NovaSeq 6000 è il sequenziatore Illumina più potente. Sfrutta la tecnologia di sequencing by synthesis (SBS) per fornire dati e prestazioni accurati e incorpora la tecnologia patterned dual flow cell per generare un livello di capacità di sequenziamento (6000 Gb) e applicazioni senza precedenti.

​​​​​​​The NextSeq 2000 System is a highly flexible and scalable benchtop system that generated up to 360 Gb per run. It supports a broad range of standard mid-throughput NGS methods such as exome sequencing, target enrichment, single-cell profiling and transcriptome sequencing as well as emerging techniques, including spatialomics. It allows a rapid, accurate, on-cloud or on-board data analysis. Il sistema NextSeq 2000 è un sequenziatore da banco altamente flessibile e scalabile che genera fino a 360 Gb per corsa. Supporta un’ampia gamma di metodi standard NGS a medio throughput, quali exome sequencing, target enrichment, single-cell profiling and transcriptome sequencing, nonché tecniche emergenti, tra cui la spatialomics. Consente un’analisi dei dati rapida, accurata, on-cloud o on-board.

PromethION 48 è un sequenziatore Nanopore high-throughput che utilizza la tecnologia di sequenziamento a singola molecola. Consente di eseguire fino a 48 esperimenti di sequenziamento in contemporanea o singolarmente, con rese fino a 9.600 Gbasi.

Il Chromium Controller utilizza una microfluidica avanzata per eseguire in pochi minuti la separazione ed il barcoding di singole cellule. Grazie alla tecnologia Next GEM, il Chromium Controller consente l’analisi integrata di singole cellule su scala massiva, permettendo di studiare le dinamiche di espressione genica e il profilo molecolare di singoli tipi di cellule. Il Chromium Controller corre low- e standard-throughput assays.

Il Chromium X è in grado di analizzare da centinaia a centinaia di migliaia di cellule in una singola run, rendendo routinari gli studi su milioni di cellule e gli studi su larga scala più accessibili e pratici. Il Chromium X è compatibile con tutti gli attuali single cell assays 10x, compresi quelli low-, standard- e high-throughput. Con lo high-throughput assay, è possibile analizzare fino a 20.000 cellule/nuclei per singola reazione o fino a 60.000 cellule/nuclei quando si utilizzano reagenti per multiplexing.

​​​​​​​Il Chromium Connect è un sistema che combina la tecnologia proprietaria 10x di microfluidica offerta dal Chromium Automated Controller con un liquid handling preciso e automatizzato che consente agli utenti di eseguire un workflow end-to-end di costruzione di librerie 10x Genomics con un’interazione minima da parte dell’utente.

Il sistema da banco Singulator consente la dissociazione riproducibile, rapida e senza intervento manuale di un’ampia gamma di tessuti in sospensioni di cellule singole o nuclei. È possibile ottenere sospensioni di nuclei o di cellule ad alta vitalità per un’ampia gamma di analisi single-cell. La capacità di eseguire la dissociazione a freddo riduce al minimo nelle cellule l’espressione di geni stress-related e aiuta a preservare la qualità dell’RNA nei nuclei.

Il BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System consente la cattura di singole cellule ed il barcoding di centinaia fino a migliaia di singole cellule per analisi genomiche e proteomiche, utilizzando una tecnologia proprietaria di microwell-based single-cell partitioning al contempo delicata e robusta.

Il cellenONE® F1.4 si basa su tecnologie di multi-fluorescence image-based single-cell sorting e consente la rilevazione e l’imaging di marcatori fluorescenti eccitati fino ad un massimo di 4 sorgenti luminose diverse. Permette il sorting e la dispensazione delicata di qualsiasi composto biologico attivo e di cellule.

Il Visium Spatial Gene Expression è un metodo di profilazione molecolare di nuova generazione per classificare i tessuti basato sull’mRNA totale. Mappa l’intero trascrittoma associato al contesto morfologico in tessuti FFPE o fresh-frozen per individuare nuovi elementi nella ricerca di base, delle malattie e nella ricerca clinica traslazionale.

Il GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) fornisce un contesto morfologico negli esperimenti di spatial transcriptomics e spatial proteomics a partire da un solo vetrino. Dalla discovery research alla ricerca traslazionale, il DSP GeoMx è la soluzione di spatial biology più flessibile e robusta, progettata per adattarsi alle vostre esigenze di ricerca in continua evoluzione.

Il nuovo Visium CytAssist è uno strumento compatto da banco che consente il trasferimento di sonde trascrittomiche dai vetrini standard ai vetrini Visium, permettendo così di ottenere la profilazione spaziale da un numero ancora maggiore di campioni. Compatibile con sezioni di tessuto colorate con ematossilina ed eosina (H&E) o con immunofluorescenza (IF), Il CytAssist consente di utilizzare tessuti presezionati per il flusso di lavoro Visium. E’ possibile massimizzare ulteriormente gli esperimenti di Visium effettuando lo screening di sezioni di tessuto usando tecniche istologiche standard per identificare sezioni biologicamente significative e quindi allineare con precisione tali sezioni all’interno della Capture Area del vetrino Visium utilizzando CytAssist.