Biologia Computazionale

Sottoriva Group

Predire l’evoluzione del cancro, un paziente per volta.

Il Sottoriva Group si occupa di decifrare le dinamiche del cancro nei pazienti in termini di crescita, progressione e resistenza al trattamento attraverso approcci matematici e computazionali applicati a dati multi-omici del cancro, con l’obiettivo di predire il futuro decorso della malattia. Il Gruppo affronta il cancro come un sistema complesso, utilizzando il campionamento razionale dei tessuti e la genomica integrativa come basi per la generazione di dati. Unisce i dati generati in laboratori con modelli matematici dell’evoluzione dei tumori e metodi di apprendimento automatico, allo scopo di formulare ipotesi clinicamente guidate e testare l’impatto che avranno sui trattamenti contri il cancro.

Il lavoro del gruppo si basa su idee dal campo della genetica teorica delle popolazioni. Da decenni, i genetisti della popolazione stanno sviluppando strumenti matematici per dare un senso a complessi dati genetici. Il Sottoriva Group unisce la teoria evolutiva classica con approcci computazionali moderni e metodi di apprendimento automatico, con la profilazione multi-omica di campioni di pazienti e metodi sperimentali per studiare l’evoluzione dei tumori in modo quantitativo. La ricerca si concentra in particolar modo su:

  1. Misurare l’evoluzione del cancro nei pazienti: utilizzando l’eterogeneità intra-tumorale per quantificare l’evoluzione del tumore nelle neoplasie umane.
  2. Predire l’evoluzione del cancro: osservando l’evoluzione temporale e la profilazione genomica spaziale per predire il decorso della malattia.
  3. Progettazione di trattamenti informati sull’evoluzione: sviluppo di sistemi modello per la sperimentazione evolutiva per identificare nuove strategie di trattamento.

A seguito di questo studi il Gruppo ha offerto contributi significativi al dibattito tra evoluzione neutrale vs selettiva del cancro.

Per maggiori informazioni: https://www.sottorivalab.org/

Membri del gruppo