Project Score: un database per aiutare lo sviluppo della prossima generazione di farmaci antitumorali
26 Ottobre 2020
Project Score: un database per aiutare lo sviluppo della prossima generazione di farmaci antitumorali
Francesco Iorio, Group Leader presso il Center for Computational Biology, è co-autore di un nuovo paper pubblicato da Nuclear Acids Research in cui viene descritta la creazione del sito Project Score: un portale web che consente agli utenti di stimare il potenziale di ogni gene come target terapeutico per nuovi farmaci antitumorali.
Project Score, creato e mantenuto dal gruppo di Mathew Garnett presso il Wellcome Sanger Institute, permette di scaricare gratuitamente ed esplorare in maniera interattiva datasets di genomica funzionale e analizzare specifiche ipotesi biologiche. Ad esempio, inserendo il nome di un qualsiasi gene, il sistema offrirà ulteriori informazioni sul punteggio dello specifico gene come futuro bersaglio terapeutico, i sui potenziali biomarcatori e la trattabilità corrente, ovvero se sono già disponibili farmaci per inibire la corrispondente proteina codificata.
I dati utilizzati dal portale sono stati generati attraverso uno screening di inattivazione genetica con il sistema CRISPR-cas9 a livello di intero genoma eseguito su centinaia di modelli di cancro. Questo ha consentito di comprendere meglio la funzione di ciascun gene e di individuare le dipendenze selettive delle cellule tumorali. Il sistema si basa su una tecnologia informatica sviluppata da Francesco Iorio, Fiona Behan e Mathew Garnett e su dati e risultati descritti in un articolo scientifico pubblicato lo scorso anno su Nature, nell’ambito dell’iniziativa Cancer Dependency Map.
Due ricercatori dello Human Technopole hanno ricevuto la Marie Curie postdoctoral fellowship, una delle più prestigiose borse di studio per giovani ricercatori: il dott. Carlos Jiménez e il dott. Albert Navarro Gallinad. Il progetto di ricerca del dott. Navarro Gallinad, presentato oggi in occasione della Giornata nazionale della salute della donna, indagherà i rischi ambientali a cui sono soggette le donne in gravidanza, analizzando quasi 1.000.000 parti avvenuti in Lombardia negli ultimi dodici anni. Il dott. Jiménez studierà come la disposizione spaziale che assumono le proteine nucleari contribuisca a ottimizzare il funzionamento della cellula.
Sono tre i giovani scienziati dello Human Technopole che, per la prima volta dalla sua fondazione, hanno conseguito un dottorato di ricerca portando avanti il loro percorso all’interno dell’istituto: Alessandro Vinceti, Davide Castaldi e Marco Tullio Rigoli, tutti iscritti al programma di systems medicine della Scuola Europea di Medicina Molecolare (SEMM).
Milano significa anche ricerca, e quest’anno Human Technopole prende parte alla campagna di promozione della città in vista della Milano Design Week, che si terrà dal 15 al 21 Aprile 2024.
La scorsa settimana il direttore di Human Technopole Marino Zerial è stato invitato a dare la Lectio Magistralis durante la cerimonia di inaugurazione dell’anno accademico 2023-2024 all’Università di Genova.
Un nuovo metodo di sequenziamento fa luce sulla diversità e sulla complessità dei DNA circolari extracromosomici (eccDNA) nelle singole cellule.
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