Project Score: un database per aiutare lo sviluppo della prossima generazione di farmaci antitumorali
26 Ottobre 2020
Project Score: un database per aiutare lo sviluppo della prossima generazione di farmaci antitumorali
Francesco Iorio, Group Leader presso il Center for Computational Biology, è co-autore di un nuovo paper pubblicato da Nuclear Acids Research in cui viene descritta la creazione del sito Project Score: un portale web che consente agli utenti di stimare il potenziale di ogni gene come target terapeutico per nuovi farmaci antitumorali.
Project Score, creato e mantenuto dal gruppo di Mathew Garnett presso il Wellcome Sanger Institute, permette di scaricare gratuitamente ed esplorare in maniera interattiva datasets di genomica funzionale e analizzare specifiche ipotesi biologiche. Ad esempio, inserendo il nome di un qualsiasi gene, il sistema offrirà ulteriori informazioni sul punteggio dello specifico gene come futuro bersaglio terapeutico, i sui potenziali biomarcatori e la trattabilità corrente, ovvero se sono già disponibili farmaci per inibire la corrispondente proteina codificata.
I dati utilizzati dal portale sono stati generati attraverso uno screening di inattivazione genetica con il sistema CRISPR-cas9 a livello di intero genoma eseguito su centinaia di modelli di cancro. Questo ha consentito di comprendere meglio la funzione di ciascun gene e di individuare le dipendenze selettive delle cellule tumorali. Il sistema si basa su una tecnologia informatica sviluppata da Francesco Iorio, Fiona Behan e Mathew Garnett e su dati e risultati descritti in un articolo scientifico pubblicato lo scorso anno su Nature, nell’ambito dell’iniziativa Cancer Dependency Map.
Human Technopole apre le Piattaforme Nazionali, strumentazioni e tecnologie all’avanguardia accessibili tramite bandi aperti alla comunità scientifica italiana. I progetti verranno selezionati da una commissione di esperti internazionali. Gli scienziati potranno accedere a cinque nuove strutture dedicate, catalizzatrici di open innovation nel settore delle scienze della vita, cruciale per la ricerca e la salute degli italiani.
Un team internazionale di scienziati, guidato dai ricercatori di HT Magda Bienko e Nicola Crosetto, ha sviluppato un software open-source per la deconvoluzione di immagini di microscopia a fluorescenza a campo largo e scansioni di tessuti di grandi dimensioni. Questo nuovo strumento aumenta le informazioni ottenute con i metodi di omica spaziale basati sulla microscopia […]
I ricercatori di Human Technopole fanno parte di un team internazionale di scienziati che ha scoperto indizi genetici sulla causa della sindrome delle gambe senza riposo, una condizione comune tra gli adulti più anziani. La scoperta potrebbe aiutare a identificare gli individui a maggior rischio di questa condizione e indicare potenziali modi per trattarla.
Human Technopole (HT) è lieta di annunciare la disponibilità di 4 nuove posizioni di dottorato completamente finanziate nei settori Health Data Science, Population and Medical Genomics e Computational Biology. Incoraggiamo le candidature di laureati altamente motivati con un solido background accademico, interessati a ricerche all’avanguardia nel campo della scienza dei dati.
Human Technopole offre fino a 19 borse di dottorato della durata di 4 anni a giovani scienziati della comunità nazionale e internazionale che desiderano intraprendere un dottorato in Biologia Computazionale, Genomica, Neurogenomica, Biologia Strutturale e Modellazione Biofisica.
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